Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия населения является одним из основных условий реализации конституционных прав граждан на охрану здоровья и благоприятную окружающую среду.

15 сентября 1922 года с принятием Советом Народных Комиссаров РСФСР декрета «О санитарных органах республики» началась история Государственной санитарно-эпидемиологической службы России. Развитие и совершенствование госсанэпидслужбы России, которая неоднократно изменялась и реорганизовывалась, способствовали усилению государственного санитарного надзора, опирающегося на законодательную, нормативную базы и научные достижения.

Сегодня государственная санитарно-эпидемиологическая служба Томской области обеспечивает стабильную санитарно-эпидемиологическую обстановку в регионе.

Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Томской области области» является учреждением здравоохранения, обеспечивающим деятельность Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в Томской области. Он создан на основании распоряжения Правительства Российской Федерации от 13 января 2005 года № 23-р путем слияния федеральных государственных учреждений — Центров Госсанэпиднадзора и в настоящее время имеет 5 филиалов.